Thực hiện Chỉ thị số 07/CT-TTg của Thủ tướng Chính phủ, Chỉ thị số 14/CT-UBND ngày 12/9/2013 của UBND tỉnh về việc cải cách hành chính; các Trung tâm, Bệnh viện trong Ngành Y tế đã nghiêm túc thực hiện trong thời gian qua.
Các nội dung tập trung cải cách hành chính trọng tâm của các Trung tâm, Bệnh viện là cải cách thủ tục hành chính công, thủ tục hành chính, phác đồ, bảng kiểm, quy trình, quy chế, quy định…để thực hiện tốt các hoạt động chuyên môn của ngành.
Bệnh viện khu vực Cam Ranh đã triển khai dịch vụ lấy số thứ tự khám qua tin nhắn điện thoại; các Bệnh viện Cam Lâm, Vạn Ninh, Ninh Hòa, Diên Khánh…đều tổ chức bàn hướng dẫn giúp khách hàng, người đi khám bệnh thuận lợi trong việc đi khám chữa bệnh.
Đối với công tác văn thư, lưu trữ đã được tổ chức nề nếp; việc soạn thảo, ban hành văn bản hành chính đều được sử dụng qua mạng intenet gửi đến trạm y tế, giảm chi phí giấy tờ, in ấn. Tại trạm y tế bước đầu áp dụng bệnh án điện tử.
Việc chú trọng cải tiến quy trình khám chữa bệnh, quy trình thủ tục đón tiếp, nâng cao trình độ chuyên môn cùng với cơ sở vật chất các bệnh viện được xây mới, sạch đẹp, khang trang. Phải nói rằng đã đem lại hình ảnh mới cho các Bệnh viện, Trung tâm Y tế của tỉnh Khánh Hòa thay đổi cả về chất và lượng, qua đó đáp ứng tốt sự hài lòng của người bệnh và người nhà người bệnh.